L'objectif principal des activités du CEBio-Eco/AO est de promouvoir durablement les écosystèmes tout en contribuant au bien-être des populations. Selon le ministre de l'Environnement et de la Transition écologique, « l’objectif principal de ce projet de Centre d'excellence est de contribuer à la gestion durable des écosystèmes en Afrique de l'Ouest mais également au bien-être des communautés locales ». A l’en croire, « ce centre est d'une très grande importance » puisqu’on « on note de plus en plus une érosion sans précédent de la biodiversité, une érosion qui est due souvent à la fragmentation des habitats et du déboisement des forêts ». Ce projet de Centre d'excellence regroupe les 15 pays de la CEDEAO et la Mauritanie sur un financement de l'UE pour un montant de 8 millions d'euros (5.246.017.675 F CFA) dont 5 millions d'euros (3.278.761.047 F. CFA) pour la mise en œuvre et 3 millions d'euros (1.967.256.628 F CFA) pour la coordination des trois centres d'excellence sur la biodiversité qui se trouvent en Afrique de l'Ouest en Afrique Centrale et Australe.